Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ME1P48163 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ME1P48163 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ME1P48163 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms