Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms