Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CTSSP25774 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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