Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GCSHP23434 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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