Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LMNB1P20700 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMNB1P20700 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms