Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRHP20396 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRHP20396 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRHP20396 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRHP20396 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRHP20396 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRHP20396 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRHP20396 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRHP20396 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRHP20396 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRHP20396 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms