Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPBP14678 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms