Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2F2P13984 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms