Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAA1P09110 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms