Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms