Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNB1P01574 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms