Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD5O60279 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms