Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIP1O00291 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIP1O00291 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms