Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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