Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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KRTAP4-16G5E9R7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP4-16G5E9R7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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