Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHMG1C9JSJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms