Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A0A0J9YYE9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms