Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFR3BQ9Y2G0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFR3BQ9Y2G0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFR3BQ9Y2G0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms