Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPS1Q9UHF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPS1Q9UHF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPS1Q9UHF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms