Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphs1Q9QZS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphs1Q9QZS7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nphs1Q9QZS7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nphs1Q9QZS7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms