Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl35Q9CZ49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl35Q9CZ49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl35Q9CZ49 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl35Q9CZ49 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms