Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MINDY3Q9CV28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MINDY3Q9CV28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MINDY3Q9CV28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms