Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC3

Ndufa10, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa10Q99LC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufa10Q99LC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndufa10Q99LC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufa10Q99LC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufa10Q99LC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms