Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col26a1Q91VF6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col26a1Q91VF6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col26a1Q91VF6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col26a1Q91VF6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col26a1Q91VF6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms