Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a3Q8K0H7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc45a3Q8K0H7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a3Q8K0H7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a3Q8K0H7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms