Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTN4Q8IWV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN4Q8IWV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN4Q8IWV2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms