Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRAPQ7Z569 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRAPQ7Z569 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRAPQ7Z569 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRAPQ7Z569 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRAPQ7Z569 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRAPQ7Z569 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRAPQ7Z569 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAPQ7Z569 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRAPQ7Z569 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRAPQ7Z569 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms