Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NinlQ6ZQ12 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NinlQ6ZQ12 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NinlQ6ZQ12 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NinlQ6ZQ12 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NinlQ6ZQ12 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NinlQ6ZQ12 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
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