Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Paxip1Q6NZQ4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Paxip1Q6NZQ4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Paxip1Q6NZQ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Paxip1Q6NZQ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Paxip1Q6NZQ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms