Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctnna3Q65CL1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna3Q65CL1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctnna3Q65CL1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms