Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Supt6hQ62383 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Supt6hQ62383 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Supt6hQ62383 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Supt6hQ62383 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Supt6hQ62383 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Supt6hQ62383 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms