Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2L5

Gm904, Gene model 904, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm904Q3V2L5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm904Q3V2L5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm904Q3V2L5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm904Q3V2L5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms