Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfgef3Q3UGY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arfgef3Q3UGY8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Arfgef3Q3UGY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms