Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC1Q13547 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC1Q13547 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC1Q13547 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
HDAC1Q13547 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC1Q13547 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC1Q13547 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC1Q13547 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC1Q13547 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC1Q13547 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC1Q13547 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
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