Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.65□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 SPG5YMR191W 1122 nt5.65□□□□□ -1.5
HRD1Q08109 RIO1YOR119C 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YGL102CYGL102C 429 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 OPI8YKR035C 642 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 RPL31BYLR406C 342 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 CUE4YML101C 354 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 MRPL19YNL185C 477 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 snR30snR30 606 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YCL049CYCL049C 939 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 UME1YPL139C 1383 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 APE4YHR113W 1473 nt5.64□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 GPH1YPR160W 2709 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 CBR1YIL043C 855 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YLR162WYLR162W 357 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 MBF1YOR298C-A 456 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 RPL5YPL131W 894 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 SMX3YPR182W 261 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 ECM38YLR299W 1983 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YLL066CYLL066C 3618 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 KTR5YNL029C 1569 nt5.63□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 BDF2YDL070W 1917 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 MRPS28YDR337W 861 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 PDA1YER178W 1263 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YSC83YHR017W 1158 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YJL144WYJL144W 315 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 ATG36YJL185C 882 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YLL056CYLL056C 897 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 TMA46YOR091W 1038 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 ARP3YJR065C 1350 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 ISC1YER019W 1434 nt5.62□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 HIS1YER055C 894 nt5.61□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 PUP2YGR253C 783 nt5.61□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 SUR7YML052W 909 nt5.61□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 PPM2YOL141W 2088 nt5.61□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 ADH5YBR145W 1056 nt5.61□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YPR204WYPR204W 3099 nt5.61□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 PHO3YBR092C 1404 nt5.6□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 PEX31YGR004W 1389 nt5.6□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YKR032WYKR032W 315 nt5.6□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YHR020WYHR020W 2067 nt5.6□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 SAC6YDR129C 1929 nt5.6□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 YDR415CYDR415C 1125 nt5.59□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 PRI1YIR008C 1230 nt5.59□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 CYS3YAL012W 1185 nt5.59□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 IRC11YOR013W 471 nt5.59□□□□□ -1.51
HRD1Q08109 SLA2YNL243W 2907 nt5.58□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SKN1YGR143W 2316 nt5.58□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 HSP12YFL014W 330 nt5.58□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YJR107WYJR107W 987 nt5.58□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 PAT1YCR077C 2391 nt5.58□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SGV1YPR161C 1974 nt5.58□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 LAT1YNL071W 1449 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 RGD1YBR260C 2001 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 HED1YDR014W-A 489 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 DYS1YHR068W 1164 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 AIM46YHR199C 933 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SWD1YAR003W 1281 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YOX1YML027W 1158 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YPR076WYPR076W 375 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 ICP55YER078C 1536 nt5.57□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SUB2YDL084W 1341 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YHC3YJL059W 1227 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 TOS6YNL300W 309 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 FIT2YOR382W 462 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 RSA4YCR072C 1548 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YJL163CYJL163C 1668 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 PCS60YBR222C 1632 nt5.56□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 STE13YOR219C 2796 nt5.55□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YPT1YFL038C 621 nt5.55□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 PRE5YMR314W 705 nt5.55□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YOR300WYOR300W 309 nt5.55□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 NTE1YML059C 5040 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 QNS1YHR074W 2145 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YUR1YJL139C 1287 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SML1YML058W 315 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 YOR268CYOR268C 399 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 EDE1YBL047C 4146 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 GEF1YJR040W 2340 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 MFG1YDL233W 1377 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 COX10YPL172C 1389 nt5.54□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 MSC3YLR219W 2187 nt5.53□□□□□ -1.52
HRD1Q08109 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.8 ms