Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
F13bQ07968 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
F13bQ07968 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
F13bQ07968 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F13bQ07968 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms