Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gjb2Q00977 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gjb2Q00977 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gjb2Q00977 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gjb2Q00977 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gjb2Q00977 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms