Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nbr1P97432 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nbr1P97432 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nbr1P97432 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nbr1P97432 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms