Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp3P63024 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp3P63024 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms