Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CastP51125 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CastP51125 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CastP51125 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CastP51125 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CastP51125 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CastP51125 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CastP51125 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CastP51125 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CastP51125 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CastP51125 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CastP51125 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CastP51125 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CastP51125 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CastP51125 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CastP51125 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CastP51125 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CastP51125 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CastP51125 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CastP51125 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CastP51125 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CastP51125 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CastP51125 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CastP51125 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CastP51125 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CastP51125 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CastP51125 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CastP51125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CastP51125 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CastP51125 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CastP51125 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CastP51125 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CastP51125 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CastP51125 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CastP51125 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CastP51125 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CastP51125 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CastP51125 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CastP51125 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CastP51125 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CastP51125 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CastP51125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CastP51125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CastP51125 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CastP51125 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CastP51125 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CastP51125 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CastP51125 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CastP51125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CastP51125 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CastP51125 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CastP51125 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CastP51125 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CastP51125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CastP51125 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CastP51125 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CastP51125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CastP51125 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CastP51125 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CastP51125 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CastP51125 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CastP51125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CastP51125 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CastP51125 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CastP51125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CastP51125 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CastP51125 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CastP51125 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CastP51125 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CastP51125 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CastP51125 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CastP51125 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CastP51125 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CastP51125 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CastP51125 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CastP51125 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CastP51125 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CastP51125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CastP51125 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CastP51125 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CastP51125 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CastP51125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CastP51125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CastP51125 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CastP51125 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CastP51125 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CastP51125 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CastP51125 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CastP51125 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CastP51125 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CastP51125 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CastP51125 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CastP51125 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CastP51125 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms