Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPH2P23942 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPH2P23942 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms