Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxa9P09631 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxa9P09631 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa9P09631 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa9P09631 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms