Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KERAO60938 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KERAO60938 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KERAO60938 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KERAO60938 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KERAO60938 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KERAO60938 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KERAO60938 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KERAO60938 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KERAO60938 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KERAO60938 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KERAO60938 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KERAO60938 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KERAO60938 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KERAO60938 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KERAO60938 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KERAO60938 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KERAO60938 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KERAO60938 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KERAO60938 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KERAO60938 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KERAO60938 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KERAO60938 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KERAO60938 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KERAO60938 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KERAO60938 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KERAO60938 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KERAO60938 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KERAO60938 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KERAO60938 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KERAO60938 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KERAO60938 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KERAO60938 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KERAO60938 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KERAO60938 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KERAO60938 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KERAO60938 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KERAO60938 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KERAO60938 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KERAO60938 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KERAO60938 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KERAO60938 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KERAO60938 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KERAO60938 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KERAO60938 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KERAO60938 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KERAO60938 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KERAO60938 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KERAO60938 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KERAO60938 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KERAO60938 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KERAO60938 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KERAO60938 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KERAO60938 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KERAO60938 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KERAO60938 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KERAO60938 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KERAO60938 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KERAO60938 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KERAO60938 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms