Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EdaO54693 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EdaO54693 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EdaO54693 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EdaO54693 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EdaO54693 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EdaO54693 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EdaO54693 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EdaO54693 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EdaO54693 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EdaO54693 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EdaO54693 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EdaO54693 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EdaO54693 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EdaO54693 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EdaO54693 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EdaO54693 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EdaO54693 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EdaO54693 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EdaO54693 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EdaO54693 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EdaO54693 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EdaO54693 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EdaO54693 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EdaO54693 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EdaO54693 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EdaO54693 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EdaO54693 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EdaO54693 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EdaO54693 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EdaO54693 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EdaO54693 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EdaO54693 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EdaO54693 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EdaO54693 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EdaO54693 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EdaO54693 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EdaO54693 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EdaO54693 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EdaO54693 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EdaO54693 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EdaO54693 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EdaO54693 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EdaO54693 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EdaO54693 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EdaO54693 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EdaO54693 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EdaO54693 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EdaO54693 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EdaO54693 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EdaO54693 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EdaO54693 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EdaO54693 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EdaO54693 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EdaO54693 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EdaO54693 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EdaO54693 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EdaO54693 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EdaO54693 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EdaO54693 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EdaO54693 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EdaO54693 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EdaO54693 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EdaO54693 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EdaO54693 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms