Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sfta2E9PXB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Sfta2E9PXB6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms