Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ9

Pdzrn4, PDZ domain-containing RING finger 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn4E9PUZ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdzrn4E9PUZ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdzrn4E9PUZ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdzrn4E9PUZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdzrn4E9PUZ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms