Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fibcd1A2AV25 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fibcd1A2AV25 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fibcd1A2AV25 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fibcd1A2AV25 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms