Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AUP1Q9Y679 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms