Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX8Q9Y5X2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms