Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms